команда pair_style косинус/квадрат — документация LAMMPS
Синтаксис
парный стиль косинус/квадрат отсечки
pair_coeff i j eps сигма pair_coeff i j eps сигма-отсечка Pair_coeff i j eps sigma wca Pair_coeff i j eps сигма отсечка wca
i,j = тип частиц
eps = сила взаимодействия, т.е. глубина потенциального минимума (энергетические единицы)
сигма = расстояние минимума потенциала от 0
cutoff = предельное расстояние для этого типа пары, если оно отличается от глобального (единицы расстояния)
wca = если указано, добавляется потенциал Уикса-Чендлера-Андерсена (с силой eps и минимумом в сигме), иначе не
Примеры
парный стиль косинус/квадрат 3.0 парный_коэфф * * 1,0 1,3 парный_коэфф 1 3 1,0 1,3 2,0 пары_коэфф 1 3 1,0 1,3 wca Pair_coeff 1 3 1,0 1,3 2,0 wca
Описание
Стиль 92&\quad \sigma \leq r < r_c \\ 0& \quad r \geq r_c \end{case}\end{split}\]
между двумя точечными частицами, где (\(\sigma, -\epsilon\))
расположение (самого правого) минимума потенциала, как объяснено в
раздел синтаксиса выше.
Впервые этот потенциал был использован (Куком) для крупнозернистого липидного мембранная модель. Как правило, это очень полезно в качестве неспецифического потенциал взаимодействия, потому что он полностью регулируется по глубине и ширине при соединении минимума в (сигма, -эпсилон) и нуля в (отсечка, 0) плавно, не требуя смещения и не вызывая сопутствующих артефактов, хвост энергетические расчеты и т. д. Очевидно, для этого требуется 96 + 1\вправо] , \quad r < \sigma\]
В этом и только в этом случае параметр \(\sigma\) может быть равен отсечка (\(\sigma =\) отсечка), что приведет ТОЛЬКО к потенциалу WCA используется (и вывести предупреждение), так что минимум будет достигнут при (сигма, 0). Это удобная функция, которая позволяет отталкивающий потенциал для использования без необходимости определения дополнительного парный стиль и используйте гибридные стили.
Энергия и сила этого парного стиля для параметров эпсилон = 1.0,
показаны сигма = 1,0, отсечка = 2,5, с потенциалом WCA и без него.
на графиках ниже:
Микширование, сдвиг, таблица, коррекция хвоста, перезапуск, информация rRESPA
Смешивание не поддерживается для этого стиля.
Опции shift , table и tail не актуальны для этого стиля.
Этот парный стиль записывает свою информацию в бинарные файлы перезапуска, поэтому командам pair_style и pair_coeff не нужно для указания во входном скрипте, который читает файл перезапуска.
Эти парные стили можно использовать только через пара ключевое слово команда run_style respa. Они не поддерживают внутренний , средний , внешний ключевые слова.
Ограничения
По умолчанию
нет
(Кук) «Кук, Кремер и Дезерно, Phys.