Сеть обмена сообщениями Matrix в настоящее время насчитывает более 60 миллионов пользователей.
Открытая сеть Matrix для децентрализованного общения объявила о рекордном росте на 79% за последние 12 месяцев, насчитывая более 60 миллионов пользователей.
Это важная веха для проекта, управляемого небольшой командой разработчиков и волонтеров, которые работают над созданием безопасной и конфиденциальной альтернативы современным средствам обмена сообщениями и совместной работы.
Ускоренный рост
Согласно пресс-релизу, предоставленному BleepingComputer, децентрализованная сеть обмена сообщениями Matrix добавила к своим услугам рекордные 25 миллионов пользователей в прошлом году, что в основном стало результатом трех событий.
Во-первых, популярность приложения Element начала расти, поскольку физические и юридические лица, ищущие безопасную платформу для совместной работы, теперь признают преимущества проекта по сравнению с обычными продуктами.
Во-вторых, прошлым летом вся система здравоохранения Германии решила внедрить Matrix, в результате чего более 150 000 организаций в стране постепенно перейдут на стандарт.
В-третьих, в мае 2022 года Rocket.Chat объявил, что начнет поддерживать протокол Matrix, что даст 12 миллионам пользователей возможность общаться с другими пользователями через более широкую сеть Matrix.
«Новая веха Matrix, превысившая 60 миллионов пользователей, является явным признаком того, что пользователи не хотят подвергаться воздействию приложений для обмена сообщениями, финансируемых за счет рекламы, которые извлекают их информацию», — сказал соучредитель и генеральный директор Matrix Мэтью Ходжсон. электронная почта.
Децентрализованный открытый стандарт — это наиболее разумный и жизнеспособный путь вперед для связи, точно так же, как HTTP лежит в основе Интернета. Он предоставляет пользователям и поставщикам возможности взаимодействия, безопасности и владения данными. Все стороны имеют свой собственный контроль и выбор.
Движение вперед
Следующей важной вехой, которую ставит перед собой команда Matrix, является достижение 100 миллионов пользователей. Проект считает, что этого можно добиться, сделав протокол еще более привлекательным с технической точки зрения.
Они планируют внедрить следующие функции:
- Децентрализованные видеоконференции E2EE : Matrix уже поддерживает VoIP для небольших групп и в настоящее время строится для масштабирования до сотен одновременных пользователей.
- Одноранговая сеть Matrix : превращает устройства в серверы для создания чистой P2P-сети, делая Matrix еще более распределенной и отказоустойчивой.
- Третья комната : децентрализованная платформа метавселенной с открытым исходным кодом, полностью построенная на основе протокола Matrix. Third Room позволит людям открывать и создавать виртуальные миры для совместной работы, защищая при этом свою конфиденциальность и сохраняя право собственности на свои данные.
Если вы хотите протестировать Matrix самостоятельно, лучше всего начать с Element, выбрав подходящую версию для вашей платформы на официальной странице загрузки.
Билл Тулас
Билл Тулас (Bill Toulas) — писатель по технологиям и репортер новостей информационной безопасности с более чем десятилетним опытом работы в различных интернет-изданиях. Сторонник открытого исходного кода и энтузиаст Linux в настоящее время находит удовольствие в отслеживании взломов, кампаний вредоносного ПО и инцидентов с утечкой данных, а также в изучении сложных способов, с помощью которых технологии быстро меняют нашу жизнь.- Предыдущая статья
- Следующая статья
Вам также может понравиться:
Что такое Cell Ranger? -Программное обеспечение -Выражение гена одной клетки -Официальная поддержка геномики 10x
Cell Ranger 7.
1 (последняя версия), напечатано 05.02.2023
Cell Ranger представляет собой набор конвейеров анализа, которые обрабатывают данные отдельных клеток Chromium для выравнивания считываний, генерации матрицы функциональных штрих-кодов, выполнять кластеризацию и другой вторичный анализ и многое другое (см. список примеров рабочих процессов и поддерживаемых библиотек). Cell Ranger включает в себя пять пайплайнов, относящихся к решениям для экспрессии генов 3′ Single Cell и сопутствующим продуктам:
Cellranger mkfastq демультиплексирует файлы необработанных базовых вызовов (BCL), созданные секвенсорами Illumina, в файлы FASTQ. Это оболочка для bcl2fastq от Illumina с дополнительными функциями, характерными для библиотек 10x Genomics, и упрощенным форматом листа образцов.
cellranger count берет файлы FASTQ из cellranger mkfastq и выполняет выравнивание, фильтрацию, подсчет штрих-кодов и подсчет UMI.
Он использует клеточные штрих-коды Chromium для создания матриц штрих-кодов признаков, определения кластеров и выполнения анализа экспрессии генов. 9Конвейер 0089 count может принимать данные от нескольких циклов секвенирования в одной и той же лунке GEM. cellranger count также обрабатывает данные Feature Barcode вместе со считыванием Gene Expression.cellranger multi используется для анализа данных мультиплексирования клеток и профилирования фиксированной РНК. Он принимает файлы FASTQ от cellranger mkfastq и выполняет выравнивание, фильтрацию, подсчет штрих-кодов и подсчет UMI. Он использует клеточные штрих-коды Chromium для создания матриц штрих-кодов признаков, определения кластеров и выполнения анализа экспрессии генов. 9Конвейер 0089 cellranger multi также поддерживает анализ данных Feature Barcode.
cellranger aggr объединяет выходные данные нескольких прогонов cellranger count или cellranger multi , нормализуя эти прогоны до одинаковой глубины секвенирования, а затем пересчитывая матрицы признаков и штрих-кодов и анализируя объединенные данные.
cellranger reanalyze берет матрицы штрих-кодов признаков, созданные cellranger count , cellranger multi или cellranger aggr , и повторно запускает алгоритмы уменьшения размерности, кластеризации и экспрессии генов с использованием настраиваемых параметров.
Он использует клеточные штрих-коды Chromium для создания матриц штрих-кодов признаков, определения кластеров и выполнения анализа экспрессии генов. 9Конвейер 0089 count может принимать данные от нескольких циклов секвенирования в одной и той же лунке GEM. cellranger count также обрабатывает данные Feature Barcode вместе со считыванием Gene Expression.
Способы запуска Cell Ranger
- Запуск Cell Ranger на облачном анализе 10x Genomics
Пропустите загрузку и установку Cell Ranger и начните работу с облачным анализом 10x Genomics, рекомендуемым нами методом запуска конвейеров Cell Ranger для большинства новых клиентов. Используйте свой веб-браузер, чтобы легко генерировать выходные данные Cell Ranger из файлов FASTQ и объединять выходные данные из нескольких прогонов, бесплатно для каждого образца 10x Genomics.
- Установите и запустите Cell Ranger на собственной вычислительной инфраструктуре
Узнайте, как установить и запустить Cell Ranger.
Рабочие процессы
Если вы начинаете с необработанных файлов базовых вызовов (BCL), рабочий процесс Cell Ranger начинается с демультиплексирования файлов BCL для каждого каталога проточной кюветы. 10x Genomics рекомендует использовать cellranger mkfastq , как описано в разделе «Создание FASTQ». Если вы начинаете с файлов FASTQ, которые уже были демультиплексированы непосредственно с помощью bcl2fastq или bcl-convert или из общедоступного источника, такого как SRA, вы можете пропустить cellranger mkfastq и начните с подсчета сотовых рейнджеров. Пожалуйста, обратитесь к страницам Specifying Input FASTQ (count, multi) для конкретных рекомендаций по тому, какие аргументы использовать для вашего сценария.
Конкретные этапы рабочего процесса зависят от того, сколько у вас образцов, лунок GEM и проточных кювет, а также от того, включаете ли вы данные из наборов Feature Barcode, Cell Multiplexing или Fixed RNA Profiling. В этом разделе описывается несколько возможных рабочих процессов.
Один образец, одна лунка GEM, одна проточная кювета
В этом примере один образец обрабатывается через одну лунку GEM и секвенируется в одной проточной кювете . В этом случае сгенерируйте FASTQ, используя cellranger mkfastq , и запустите cellranger count , как описано в Анализе одной выборки.
В этом примере также показаны две библиотеки секвенирования . Из одной лунки GEM можно получить несколько физических библиотек: одну библиотеку Gene Expression и одну или несколько библиотек Feature Barcode.
Один образец, одна лунка GEM, несколько проточных кювет
В этом примере один образец обрабатывается через одну лунку GEM, в результате чего получается одна библиотека, секвенированная в нескольких проточных кюветах.
Этот рабочий процесс обычно выполняется для увеличения глубины секвенирования. В этом случае все операции чтения могут быть объединены в одном экземпляре конвейера cellranger count или multi . Этот процесс описан в разделе Указание входных страниц FASTQ (количество, несколько).
Один образец, несколько лунок GEM, одна проточная кювета
Здесь один образец обрабатывается через несколько лунок GEM. Обычно это делается при проведении технических повторных экспериментов. Затем библиотеки из лунок GEM объединяются в одну проточную кювету и секвенируются. В этом случае демультиплексируйте данные секвенирования с помощью cellranger mkfastq , затем запустите библиотеки из каждой лунки GEM через отдельный экземпляр cellranger count . Затем вы можете выполнить комбинированный анализ, используя cellranger aggr , как описано в Multi-Library Aggregation.
Несколько проб, несколько лунок GEM, одна проточная кювета
В этом примере несколько проб обрабатываются через несколько лунок GEM, которые создают несколько библиотек и объединяются в одну проточную кювету.
После демультиплексирования необходимо запустить Cellranger count отдельно для каждой лунки GEM; если у вас есть две скважины GEM, запустите cellranger count дважды. Затем вы можете объединить их с одним экземпляром cellranger aggr , как описано в Multi-Library Aggregation.
Несколько образцов, одна лунка GEM, одна проточная кювета (мультиплексирование клеток)
Cell Ranger 6.0 поддерживает анализ данных мультиплексирования клеток. В этом случае несколько образцов помечаются уникальной меткой Cell Multiplexing Oligos (CMO), что позволяет объединять несколько образцов в одной лунке GEM. Это приводит к библиотеке CMO и Gene Expression (GEX) для каждой лунки GEM. После запуска cellranger mkfastq для создания файлов FASTQ, запустите конвейер cellranger multi для комбинированных данных FASTQ для библиотек GEX и CMO.
Несколько образцов, одна лунка GEM, одна проточная кювета (фиксированное профилирование РНК)
Cell Ranger 7.