2Xy 5 2x y 6: Решить 2xy=5 | Microsoft Math Solver

2

RCSB PDB — 2XY6: Кристаллическая структура пары оснований салицилового альдегида в комплексе с фрагментом ДНК-полимеразы I из Bacillus stearothermophilus

  • Обзор структуры
  • 3D-вид
  • Аннотации
  • Эксперимент
  • 9 0003 Последовательность
  • Геном
  • Версии

ПредыдущийСледующий

Содержание макромолекул

  • Общий вес структуры: 72,9 кДа
  • Количество атомов: 5168
  • Смоделированное количество остатков: 601&nbsp
  • Количество депонированных остатков: 601&nbsp
  • Уникальные белковые цепи: 1
  • Уникальные цепи нуклеиновых кислот: 2
Кристаллическая структура салици альдегидная пара оснований в комплексе с фрагментом ДНК-полимеразы I из Bacillus stearothermophilus


    Проверка wwPDB Отчет 3D Полный отчет


    Это версия 1. 2 записи. См. полную&nbsисторию&nbsp9.0020

    Литература

    Образование обратимой связи Обеспечивает репликацию и амплификацию сшивающего саленового комплекса в виде ортогональной пары оснований.

    Каул К., Мюллер М., Вагнер М., Шнайдер С., Карелл Т.

    (2011) Nat Chem&nbsp 3 : 794

      90 026 PubMed :&nbsp21941252&nbspПоиск в PubMed
    • DOI: https://doi.org/10.1038/nchem.1117

    • PubMed Abstract:&nbsp
    • Универсальный генетический код основан на двух парах оснований Уотсона-Крика, связанных водородными связями, которые могут образовывать 64 триплетных кодона. Это накладывает ограничение на количество аминокислот, которые могут быть закодированы, что мотивировало усилия по созданию синтетических пар оснований, ортогональных природным …

      Универсальный генетический код основан на двух связанных водородными связями основаниях Уотсона-Крика пары, которые могут образовывать 64 триплетных кодона. Это накладывает ограничение на количество аминокислот, которые могут быть закодированы, что мотивировало усилия по созданию синтетических пар оснований, ортогональных природным. Дополнительная пара оснований даст еще 61 триплетный кодон. Искусственные пары органических оснований были описаны в исследованиях ферментативного включения, а неорганические пары оснований T-Hg-T и C-Ag-C, как сообщалось, образовывались в исследованиях удлинения праймера. Здесь мы демонстрируем пару металлических оснований, которая полностью ортогональна и может быть реплицирована и даже может быть амплифицирована с помощью полимеразной цепной реакции в присутствии канонических пар dA:dT и dG:dC. Кристаллические структуры пары оснований dS-Cu-dS внутри полимеразы показывают, что обратимая химия возможна непосредственно внутри полимеразы, что позволяет эффективно копировать неорганическую сшивку. Результаты открывают возможность репликации и амплификации искусственных неорганических наноструктур ДНК путем расширения генетического алфавита.


      Организационная принадлежность :&nbsp

      Центр комплексных белковых исследований при химическом факультете Университета Людвига-Максимилиана в Мюнхене, Butenandtstrasse 5-13, D-81377 Мюнхен, Германия.



    Макромолекулы


    Найдите похожие белки по: 

    (по порогу идентичности)  | Трехмерная структура

    Идентификатор объекта: 1
    Молекула Цепи Длина последовательности Организм Детали Изображение
    ДНК-ПОЛИМЕРАЗА I A 581 9012 7 Geobacillus stearothermophilus Мутация(и) : 0&nbsp
    Названия генов:&nbsp polA
    EC:&nbsp 2.7.7.7
    UniProt

    Найти белки для&nbspE1C9K5 (Geobacillus stearothermophilus)

    Исследовать&nbspE1C9K5&nbsp

    Перейти к UniProtKB:&nbspE1C9K5

    Группы объектов &nbsp
    Кластеры последовательностей 30% Идентичность50% Идентичность70% Идентичность90% Идентичность95% Идентичность100% Идентичность
    UniProt Group 90 127 E1C9K5
    Просмотр свойств белка
    Расширить
    • Эталонная последовательность

    Найдите похожие нуклеиновые кислоты по:  Последовательности   | Трехмерная структура  

    Идентификатор объекта: 2
    Молекула Цепи Длина Организм Изображение
    5′-D(*GP*AP*CP*CP*SAYP* TP*CP*CP*CP*TP)-3′ B 10 синтетическая конструкция
    Protein Feature View
    Expand
    • Эталонная последовательность

    Найти похожие нуклеиновые кислоты по:  Последовательности   | Трехмерная структура  

    Идентификатор объекта: 3
    Молекула Цепи Длина Организм Изображение
    5′-D(*AP*GP*GP*GP*AP* SAYP*GP*GP*TP*CP)-3′ C 10 синтетическая конструкция
    Представление характеристик белка
    Расширение
    • Эталонная последовательность 9000 4

    Малые молекулы

    9 0112 Имя / Formula / InChI Key
    Лиганды&nbsp3 Уникальные
    ID Цепи 2D Diagram 3D Interactions
    MES
    Query on MES

    Download CCD File Идеальные координаты&nbsp
    F [auth A] 2-(N-МОРФОЛИНО)-ЭТАНСУЛЬФОННАЯ КИСЛОТА
    C 6 H 13 N O 4 S
    SXGZJKUKBWWHRA-UHFFFAOYSA-N
      Взаимодействие лигандов
    MRD
    Запрос к MRD

    Загрузить CCD-файл идеальных координат
    G [auth A] (4R)-2-метилпентан-2,4-ди ПР
    С 6 Н 14 О 2
    SVTBMSDMJJWYQN-RXMQYKEDSA-N
      Взаимодействие с лигандом
    SO4
    Запрос на SO4

    Download Ideal Co координаты ПЗС-файла&nbsp
    D [авт. A],
    E [авт. A]
    СУЛЬФАТ-ИОН
    O 4 S
    QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L
      Взаимодействие лигандов
    90 021 Экспериментальные данные и проверка

    Экспериментальные данные

    Элементарная ячейка :

    Длина (Å) Угол (˚)
    a = 88,23 5 α = 90
    b = 93,127 β = 90
    c = 105,505 γ = 90

    Пакет программного обеспечения:

    9012 6 фазировка
    Название программного обеспечения 9010 9 Назначение
    REFMAC уточнение
    XDS сокращение данных
    SCALA масштабирование данных
    PHASER

    Посмотреть более подробные экспериментальные данные

    История входа

    Данные осаждения
    • Дата публикации: 27 июля 2011 г.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *